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手持式水質生物毒性檢測儀采用發光細菌法，遵循《GB／T15441-1995》、《ISO-11348-3》標準，所用發光細菌在正常新陳代謝時發出450-490nm的藍綠熒光，一旦遇到外界的毒性物質，就會對發光細菌的新陳代謝產生影響，進而抑制發光強度。發光細菌所受的抑制大小和外界毒性物質的毒性大小相關。